在最近的一项研究中，研究人员已经确定了最常见的儿童癌症的多种新亚型 - 这些研究可能会改善高风险患者的诊断和治疗。相关结果发表在最近一期的《Nature Genetics》杂志上。
研究人员使用整合基因组分析（包括RNA测序）来确定近2,000名儿童和成人的B细胞急性淋巴细胞白血病（B-ALL）的基因组图谱。 B-ALL是ALL中最常见的形式，也是儿童中最常见的癌症。 B-ALL仍然是儿科癌症死亡的主要原因。
研究人员确定了23种B-ALL亚型，包括8种新亚型，具有不同的基因组和临床特征以及结果。亚型患病率通常随年龄而变化。现在，超过90％的B-ALL病例可按亚型分类，而几年前这一比例为70％。
“B-ALL具有显着的分子多样性，我们和其他人已经用它来改进分类，推动精准药物的开发，以改善B-ALL的治疗和结果，”相应的作者Charles Mullighan，说道：“精确医学的一部分是准确的分子诊断，本研究为更多患者提供了这种诊断。”
转录因子基因PAX5的改变定义了两种新的亚型，包括PAX5 P80R，作为由点突变引发的第一个淋巴母细胞白血病。 “虽然二次突变是必要的并且通常涉及激酶信号传导，但我们表明这一点突变会损害B淋巴细胞的发育并促进小鼠B-ALL的发育，”作者说道。
其他PAX5亚型，PAX5改变，由基因的多种改变定义，包括序列突变或与24个其他基因之一重排。 PAX5亚型共同占了之前未分类的B-ALL病例的近10％。
新的亚型包括主要发生在成人中的高风险B-ALL。它通过用MYC或BCL6重排转录因子BCL2来定义。 “这种亚型有一个令人沮丧的诊断，”Mullighan说。 “对这种亚型定义重排的认识可能会为患者带来替代疗法。”相反，通过基因DUX4的重排定义的亚型与成人的良好预后相关，如先前在儿童中观察到的。
该研究证明了RNA测序能够识别多种类型的基因组改变，突出了该技术在白血病诊断中的实用性，特别是在没有全基因组测序的情况下。该研究中的实例包括染色体重排，导致融合基因，基因表达谱和其他改变。
资讯出处：More accurate leukemia diagnosis expected as researchers refine leukemia classification
原始出处：Zhaohui Gu et al. PAX5-driven subtypes of B-progenitor acute lymphoblastic leukemia. Nature Genetics, 2019; DOI: 10.1038/s41588-018-0315-5